يعاني قطاع الصحة ببلدية أجخرة من مشكلات وصعوبات تجعل منه غير قادر على أن يقدم خدماته للمواطنين، حيث يعاني المركز الصحي أجخرة من نقص شديد في الأدوية والمعدات وكذلك في الطواقم الطبية، بالإضافة إلى المشكلات الإدارية التي حالت دون أن يطور إلى مستشفى قروي، كما يعمل المركز الصحي بعدد قليل جدا من كادر التمريض وبطبيب واحد فقط.
ويعاني المركز من عدم اهتمام الجهات المختصة بصيانته ونظافته، فيما ناشد مدير المركز الصحي أجخرة وزير الصحة بالحكومة المؤقتة الدكتور رضا العوكلي للنظر بعين المسؤولية إلى حالهم.
